Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Lin28aQ8K3Y3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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