Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Vrk3Q8K3G5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Vrk3Q8K3G5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Vrk3Q8K3G5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Vrk3Q8K3G5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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