Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Lrrtm1Q8K377 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Lrrtm1Q8K377 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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