Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Phf13Q8K2W6 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Phf13Q8K2W6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Phf13Q8K2W6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Phf13Q8K2W6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Phf13Q8K2W6 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Phf13Q8K2W6 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Phf13Q8K2W6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Phf13Q8K2W6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Phf13Q8K2W6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Phf13Q8K2W6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Phf13Q8K2W6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Phf13Q8K2W6 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Phf13Q8K2W6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Phf13Q8K2W6 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms