Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms