Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Scara5Q8K299 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Scara5Q8K299 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms