Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pacs1Q8K212 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pacs1Q8K212 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms