Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nek9Q8K1R7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nek9Q8K1R7 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms