Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sh2d5Q8JZW5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh2d5Q8JZW5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh2d5Q8JZW5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh2d5Q8JZW5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh2d5Q8JZW5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh2d5Q8JZW5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh2d5Q8JZW5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sh2d5Q8JZW5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms