Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Znf628Q8CJ78 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Znf628Q8CJ78 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms