Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Card11Q8CIS0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Card11Q8CIS0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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Card11Q8CIS0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Card11Q8CIS0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Card11Q8CIS0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Card11Q8CIS0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
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Card11Q8CIS0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Card11Q8CIS0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
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Card11Q8CIS0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Card11Q8CIS0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms