Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV9

Tshz3, Teashirt homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,081 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tshz3Q8CGV9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tshz3Q8CGV9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tshz3Q8CGV9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms