Protein–RNA interactions for Protein: Q8CG50

Rab43, Ras-related protein Rab-43, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab43Q8CG50 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab43Q8CG50 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rab43Q8CG50 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab43Q8CG50 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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