Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hpf1Q8CFE2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hpf1Q8CFE2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hpf1Q8CFE2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hpf1Q8CFE2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hpf1Q8CFE2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Hpf1Q8CFE2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hpf1Q8CFE2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hpf1Q8CFE2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hpf1Q8CFE2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Hpf1Q8CFE2 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hpf1Q8CFE2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hpf1Q8CFE2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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