Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rdh13Q8CEE7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Rdh13Q8CEE7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rdh13Q8CEE7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rdh13Q8CEE7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Rdh13Q8CEE7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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