Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Nhlrc3Q8CCH2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Nhlrc3Q8CCH2 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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