Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Bhlhe22Q8C6A8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bhlhe22Q8C6A8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms