Protein–RNA interactions for Protein: Q8C428

Tmc7, Transmembrane channel-like protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc7Q8C428 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc7Q8C428 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc7Q8C428 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc7Q8C428 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc7Q8C428 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc7Q8C428 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc7Q8C428 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc7Q8C428 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmc7Q8C428 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Tmc7Q8C428 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmc7Q8C428 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Tmc7Q8C428 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Tmc7Q8C428 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tmc7Q8C428 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms