Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ska3Q8C263 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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