Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXN9

Tmem87a, Transmembrane protein 87A, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87aQ8BXN9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem87aQ8BXN9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem87aQ8BXN9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms