Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXL9

Iffo1, Intermediate filament family orphan 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo1Q8BXL9 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Iffo1Q8BXL9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Iffo1Q8BXL9 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms