Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Ube3dQ8BX13 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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