Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rbbp5Q8BX09 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms