Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPC6

Probable isocitrate dehydrogenase [NAD] gamma 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BPC6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q8BPC6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Q8BPC6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Q8BPC6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms