Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMK4

Ckap4, Cytoskeleton-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap4Q8BMK4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ckap4Q8BMK4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ckap4Q8BMK4 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ckap4Q8BMK4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms