Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI0

Fbxo38, F-box only protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo38Q8BMI0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo38Q8BMI0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo38Q8BMI0 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo38Q8BMI0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo38Q8BMI0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo38Q8BMI0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo38Q8BMI0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo38Q8BMI0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo38Q8BMI0 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fbxo38Q8BMI0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fbxo38Q8BMI0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fbxo38Q8BMI0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Fbxo38Q8BMI0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fbxo38Q8BMI0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms