Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zcchc4Q8BKW4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms