Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cdca8Q8BHX3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cdca8Q8BHX3 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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