Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Clrn3Q8BHH8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Clrn3Q8BHH8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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