Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Atg4dQ8BGV9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
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Atg4dQ8BGV9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Atg4dQ8BGV9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Atg4dQ8BGV9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Atg4dQ8BGV9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Atg4dQ8BGV9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Atg4dQ8BGV9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Atg4dQ8BGV9 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Atg4dQ8BGV9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Atg4dQ8BGV9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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