Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lrrtm2Q8BGA3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Lrrtm2Q8BGA3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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