Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

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Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cpped1Q8BFS6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
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