Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ChfrQ810L3 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms