Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ8

Cracr2b, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2bQ80ZJ8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cracr2bQ80ZJ8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms