Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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NanogQ80Z64 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NanogQ80Z64 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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