Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rbbp8Q80YR6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rbbp8Q80YR6 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms