Protein–RNA interactions for Protein: Q80WC9

Aasdh, Acyl-CoA synthetase family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AasdhQ80WC9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AasdhQ80WC9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AasdhQ80WC9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AasdhQ80WC9 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AasdhQ80WC9 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AasdhQ80WC9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
AasdhQ80WC9 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AasdhQ80WC9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AasdhQ80WC9 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms