Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pcsk9Q80W65 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pcsk9Q80W65 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Pcsk9Q80W65 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pcsk9Q80W65 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pcsk9Q80W65 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pcsk9Q80W65 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pcsk9Q80W65 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Pcsk9Q80W65 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pcsk9Q80W65 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pcsk9Q80W65 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Pcsk9Q80W65 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pcsk9Q80W65 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pcsk9Q80W65 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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