Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pnma8aQ80VM8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms