Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rpp38Q80UU2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rpp38Q80UU2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rpp38Q80UU2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rpp38Q80UU2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rpp38Q80UU2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rpp38Q80UU2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpp38Q80UU2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpp38Q80UU2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpp38Q80UU2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpp38Q80UU2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpp38Q80UU2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpp38Q80UU2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpp38Q80UU2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rpp38Q80UU2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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