Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rims3Q80U57 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rims3Q80U57 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms