Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
NischQ80TM9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
NischQ80TM9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NischQ80TM9 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
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