Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lamp3Q7TST5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lamp3Q7TST5 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms