Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Zfp397Q7TNK4 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms