Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sbno2Q7TNB8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sbno2Q7TNB8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms