Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Sys1Q78S06 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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