Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubfd1Q78JW9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms