Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnot1Q6ZQ08 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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