Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc88cQ6VGS5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms