Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Med16Q6PGF3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Med16Q6PGF3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms